روى الكليني بسند صحيح عن زرارة عن أبي جعفر (عليه السلام) قال : رأيت كأنّي على رأس جبل و الناس يصعدون إليه من كلّ جانب حتى إذا كثروا عليه تطاول بهم في السماء و جعل الناس يتساقطون عنه من كلّ جانب حتى لم يبق منهم أحد الّا عصابة يسيرة ففعل ذلك خمس مرّات في كلّ مرّة يتساقط عنه الناس و تبقى تلك العصابة فكأن الامام (عليه السلام) فهم من هنا وفاته ؛ قال : فما مكث بعد ذلك الّا نحوا من خمس حتى هلك (صلوات اللّه عليه‏) .

 و روى الكليني أيضا بسند معتبر انّ أبا جعفر (عليه السلام) انقلع ضرس من أضراسه فوضعه في‏ كفّه ، ثم قال : الحمد للّه ، ثم قال : يا جعفر إذا أنا متّ و دفنتني فادفنه معي، ثم مكث بعد حين ثم انقلع أيضا آخر، فوضعه على كفّه ثم قال : الحمد للّه، يا جعفر إذا متّ فادفنه معي‏ .

و روي في الكافي و بصائر الدرجات و غيرهما من الكتب المعتبرة عن الامام الصادق (عليه السلام) انّه قال : انّ أبي مرض مرضا شديدا حتى خفنا عليه فبكى بعض أهله عند رأسه فنظر إليه فقال : انّي لست بميّت من وجعي هذا، انّه أتاني اثنان فأخبراني انّي لست بميّت من وجعي هذا.

قال : فبرأ و مكث ما شاء اللّه أن يمكث فبينا هو صحيح ليس به بأس، قال : يا بني انّ اللذين أتياني من وجعي ذلك أتياني فأخبراني انّي ميّت يوم كذا و كذا، قال : فمات (عليه السلام) في ذلك اليوم‏ .

و قال الصادق (عليه السلام)  : انّ أبي (عليه السلام) قال لي ذات يوم في مرضه : يا بني أدخل أناسا من قريش من أهل المدينة حتى أشهدهم، قال : فأدخلت عليه أناسا منهم، فقال : يا جعفر إذا أنا متّ فغسّلني و كفّنّي و ارفع قبري اربع اصابع و رشّه بالماء.

فلمّا خرجوا قلت : يا أبت لو أمرتني بهذا لصنعته و لم ترد أن أدخل عليك قوما تشهدهم؟

فقال : يا بني أردت أن لا تنازع‏ .

و في رواية انّه (عليه السلام) قال : يا بني أ ما سمعت عليّ بن الحسين (عليه السلام) ناداني من وراء الجدران يا محمد تعال عجّل‏ .

و روي أيضا في بصائر الدرجات عن الامام الصادق (عليه السلام) انّه أتى أبا جعفر (عليه السلام) ليلة قبض و هو يناجي، فأومأ إليه بيده أن تأخّر، فتأخّر حتى فرغ من المناجاة ثم أتاه فقال : يا بني انّ هذه الليلة التي أقبض فيها و هي الليلة التي قبض فيها رسول اللّه (صلّى اللّه عليه و آله).

 قال : و حدّثني أنّ أباه عليّ بن الحسين (عليهما السّلام) أتاه بشراب في الليلة التي قبض فيها، و قال : اشرب هذا، فقال : يا بني انّ هذه الليلة التي وعدت أن أقبض فيها، فقبض فيها .

و روى القطب الراوندي بسند معتبر عن الصادق (عليه السلام) قال : لما كانت الليلة التي قبض فيها أبو جعفر، قال : يا بنيّ هذه الليلة التي وعدتها، و قد كان وضوءه قريبا، فقال : أريقوه أريقوه، فظنّنا أنّه يقول من الحمّى، فقال : يا بني أرقه، فأرقناه فاذا فيه فأرة .

و روى الكليني بسند معتبر صحيح عنه (عليه السلام) قال : انّ رجلا كان على أميال من المدينة فرأى في منامه فقيل له : انطلق فصلّ على أبي جعفر (عليه السلام) فانّ الملائكة تغسّله في البقيع‏.

و روي أيضا انّ أبا جعفر (عليه السلام) أوصى بثمانمائة درهم لمأتمه‏ .

و روي أيضا عن أبي عبد اللّه (عليه السلام) قال : قال لي أبي : يا جعفر أوقف لي من مالي كذا و كذا لنوادب تندبني عشر سنين بمنى أيّام منى‏ .

يقول المؤلف : وقع الخلاف في تاريخ وفاته (عليه السلام) و المختار عندي انّه (عليه السلام) توفي يوم الاثنين في السابع من ذي الحجة سنة (114) هـ و هو ابن سبع و خمسين سنة في المدينة المشرفة، و ذلك في ايّام خلافة هشام بن عبد الملك، و قيل انّ ابراهيم بن الوليد بن عبد الملك بن مروان سمّ الامام (عليه السلام) و لعلّه فعل ذلك بأمر هشام، و قبره المقدس في البقيع اجماعا جنب قبر أبيه و عمّه الامام الحسن (عليه السلام) .

و روى الكليني بسند معتبر : لما قبض أبو جعفر (عليه السلام) أمر أبو عبد اللّه (عليه السلام) بالسراج في البيت الذي كان يسكنه حتى قبض أبو عبد اللّه (عليه السلام) ‏ .